Semillero de investigación en Biología Computacional
Escuela: Ciencias
Departamento: Ciencias Biológicas
Debido al incremento en la información en bases de datos relacionadas con los sistemas biológicos, el análisis manual de los fenómenos en este campo se hace simplemente imposible. Así, con la necesidad de procesar y extraer información útil de estos datos, surgen la biología computacional y la bioinformática, las cuales aportan herramientas y métodos para facilitar su análisis.
En este sentido, el semillero busca que los estudiantes de áreas relacionadas con la biología y la computación, comiencen a apropiarse de herramientas y términos empleados para verificar las hipótesis que pueden surgir del estudio de los organismos vivos. Actualmente se está trabajando en el aprendizaje de fundamentos de programación (Python) y de ambiente Linux, aplicados a problemas biológicos, con miras al desarrollo de aplicaciones que den solución a problemas concretos en el área o que sirvan de herramienta para facilitar tareas.
En la actualidad los datos productos de investigaciones en bioinformática, como proyectos genómicos, se almacenan en grandes bases de datos públicas disponibles para su colsulta por parte de cualquiera que esté interesado. Esto permite aplicar fácilmente uno de los postulados de la ciencia: y la reproducibilidad de los resultados.
Este proyecto tiene como objetivo tomar un artículo publicado en una revista científica, cuyos datos base se encuentren disponibles en línea, y aplicar la metodología computacional reportada por los investigadores con el fin de verificar la veracidad de los resultados. Esto permite aprender las técnicas y metodologías en bioinformática aplicadas a problemas biológicos además de generar discusiones acerca del quehacer investigativo.
En la actualidad, los procesos antrópicos han generado una rápida pérdida de la diversidad biótica en el planeta que incluso ha derivado en la extinción de especies aún no reconocidas por la ciencia. El claro conocimiento de nuestra diversidad es vital no solo para generar estrategias adecuadas de conservación, sino también para identificar posibles usos y aplicaciones de estas especies para el hombre.
Los Códigos de Barras de ADN surgieron como una propuesta metodológica para acelerar la caracterización y descubrimiento de la diversidad en el planeta haciendo uso de secuencias cortas del ADN mitocondrial. A pesar del amplio uso de los Códigos de Barras de ADN en muchos países del mundo, su implementación en Colombia es incipiente y ningún proyecto a gran escala nacional ha sido desarrollado en los mamíferos.
El presente proyecto pretende caracterizar la diversidad molecular de los mamíferos del Valle de Aburrá por medio del desarrollo de un Código de Barras de ADN. Este proyecto ofrecerá una línea base con múltiples aplicaciones para cualquier campo donde se requiera la identificación de especies usando datos moleculares.
La sociedad es testigo de las repercusiones ambientales de la industrialización (de lo “artificial”) y de los graves efectos que esta tiene en la salud pública. Este fenómeno ha creado una tendencia hacia la búsqueda de soluciones naturales.
El creciente interés por los microorganismos benéficos para la salud obedece a esta búsqueda ecológica que se lleva a cabo en todas las ramas del conocimiento.
En este sentido, la comunidad científica, no ajena a esta nueva necesidad, ha direccionado sus esfuerzos a establecer tratamientos naturales válidos.
Este proyecto se enfoca en la avicultura con el fin de buscar soluciones que fortalezcan el sistema inmune y digestivo de las aves, para disminuir la mortandad y aumentar naturalmente la absorción de grasas sin necesidad de hormonas.
El objetivo general de esta investigación es crear y comercializar un suplemento dietario para aves de cultivo, totalmente natural a base de lactobacilos. El proyecto se divide en cuatro etapas, de las cuales se están desarrollando las primeras dos.